腎小球腎炎是造成尿毒症的第二大主因。腎小球腎炎是免疫反應引起的，使腎小球發炎或增生，是數十種腎小球疾病的總稱，以IgA免疫球蛋白腎病變最為常見，其他還有膜性腎病變、感染後腎小球腎炎等。依據不同的病因，有些經由治療後可痊癒，有些會使腎功能逐漸衰退或變成急性腎衰竭，甚至幾週內就演變成必須洗腎的尿毒症患者。

這種情形最明顯、也最常出現在早晨第一泡尿。因為經過一整晚睡眠沒有喝水，尿液濃縮導致尿液濃度增加；另外因為腎臟是排除蛋白質代謝產物的主要器官，當攝取較多蛋白質的時候，尿液裡的尿素增加，小便也容易出現泡泡。